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学校前身为协和医学院，由美英基督教会于光绪三十二年创办。民国元年，更名为协和医学院。北京协和医学院成立于1917年。1919年更名为北京协和医学院大学。1929年更名为私立北京协和医学院。1949年1月北平解放后，协和医学院继续办学。1951年1月，中央人民政府教育部、卫生部接管协和医学院，改称国立中国协和医学院。

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